Il Decreto Legislativo 116/08 e il Decreto Attuativo del Ministero della Salute 30 marzo 2010, recepimento della Direttiva Europea 2006/7/CE, costituiscono la normativa di riferimento per la gestione della qualità delle acque e la tutela della salute dei bagnanti.
Il litorale molisano comprende alcune aree non adibite al monitoraggio in quanto interdette alla balneazione in modo permanente (per motivi di sicurezza, portuali, o foci dei fiumi e/o torrenti). La restante costa della regione è oggetto di valutazione, dal 01 aprile al 30 settembre, attraverso controlli e campionamenti per la verifica della qualità delle acque di balneazione, con cadenza stabilita dall’ Autorità regionale (Deliberazione di Giunta Regionale N. 102 Seduta del 30-04-2021)